- Отдел организационно-правовой работы
- Отдел по вопросам государственной гражданской службы и кадров
- Отдел бухгалтерского учета и отчетности
- Отдел целевых программ и прогнозирования развития инфраструктуры рынка
- Отдел субсидий и координации мер поддержки сельскохозяйственных товаропроизводителей
- Отдел материально-технического и програмного обеспечения
- Отдел организации производства продукции растениеводства и планирования и оборота земель сельскохозяйственного назначения
- Отдел организации производства продукции животноводства и племенного дела
- Отдел пищевой и перерабатывающей промышленности
- Отдел координации развития сельских территорий и малых форм хозяйствования
- Управление государственного технического надзора
- Отдел государственного контроля за техническим состоянием самоходных машин
- Отдел регистрации самоходных машин и экзаменационной работы
- Управление ветеринарии
- Отдел противоэпизоотической работы и лечебно-профилактических мероприятий
- Отдел государственного контроля в области обращения с животными
- Отдел лабораторно-диагностической деятельности и ветеринарной экспертизы
